一、从用户体验角度来说
合理清晰的网站结构能带来较好的用户体验，如果用户能够通过清晰的点击，很快找到自己想要的信息，不但能让用户浏览方便，更有助于留住客户。从根本上说，对于用户体验好的网站，也是搜索引擎喜欢的网站，用户在网站上的行为方式，有可能会被计入排名算法中。这是为什么博客优化比较好做的原因，因为博客简单明了，主次分明是有利于搜索引擎的蜘蛛爬行收录。
二、从搜索引擎收录好处
对于搜索引擎蜘蛛来说，爬行页面内容一般是通过网站结构去抓取页面内容的，所以，合理清晰的网站结构有助于搜索引擎更好的收录页面内容。目前搜索引擎推荐的网站结构为扁平式树形网状结构。
扁平结构：所有网页都在网站根目录，形成一个扁平的物理结构。其优点是结构层次短，蜘蛛效率高，URL短，有利于搜索引擎的收录和排名。但缺点则是URL语义不明显，随着数据量的增加将使网站变得难以组织（这里需要合理使用标签），内链不好做，权重传递难以集中。所以，扁平结构适合简单垂直的中小型网站。
树型结构：网站下面有许多目录或栏目，目录或栏目中再放属于该目录或栏目的网页。结构清楚，URL语义明确，识别度高，搜索引擎处理内部链接的权值传递会比较容易，后期管理比较容易。但是过深的树层次将导致收录速度下降，而且过密的网结构也会导致网站结构混乱，链接复杂，容易导致蜘蛛效率的下降，所以，做好树型结构的栏目组织和链接优化至关重要。这种结构适合内容类别多、内容量大的网站。
三，对网站的内外链接同样重要
网站权重的优化就是从各方面的细致角度看，用结构连接起外部和内部之间的关系，建立起内外联系，更利于搜索引擎收录，比如发外部链接，不但是发链接就是，还要发链接的关键词以建立起网站内部联系，再利用结构优化指引搜索引擎。
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